Portail nord de la façade occidentale, le portail Saint-Jean date de la seconde moitié du XII^e siècle, avant l'incendie de l'an 1200. Il est surmonté par un arc en plein cintres qui le situe dans la période de transition entre l'art roman et l'art gothique. Sous cet arc, l'usure des temps n'a laissé qu'un décor en ombres chinoises qui montre que le portail était peint.
Le tympan est plus tardif. Il date du XIII^e siècle. Il représentent des scènes tirées de l'hagiographie des deux Saint-Jean. Au registre supérieur, la descente au tombeau de Saint-Jean l'Evangéliste, au registre inférieur, l'exécution de Saint-Jean Baptiste. Cette dernière a servi d'inspiration à Gustave Flaubert pour son conte Hérodiade.